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烟草全转录本基因芯片研制技术论证会在郑州召开(图)

2013年05月27日 来源:烟草在线据郑州烟草研究院网站报道 作者:
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  烟草在线据郑州烟草研究院网站报道  2013年5月15日,烟草全转录本(WT)基因芯片研制技术论证会在郑州召开。国家局科技司、烟草基因组计划重大专项首席科学家及其工作团队、云南省烟草农业科学研究院、中国烟草总公司青州烟草研究所、贵州省烟草科学研究院、湖北省烟草科研所、黑龙江省牡丹江烟草科学研究所、美国昂飞(Affymetrix)公司及国家烟草基因研究中心共25人参加了此次会议。会议由首席科学家夏庆友教授主持,基因中心林福呈主任出席会议。

会议现场

  “烟草全基因组表达图谱构建和分析”是由国家烟草基因研究中心牵头承担的烟草基因组重大专项2012年度项目,利用Affymetrix平台研制烟草WT基因芯片是核心任务指标。目前烟草基因组计划重大专项红花大金元全基因组组装及基因注释工作已经完成,根据项目进度安排,需要及时启动烟草WT基因芯片探针设计及研制策略专家论证工作。应基因中心的邀请,Affymetrix公司基因芯片业务负责人及设计团队专程来华,就烟草WT基因芯片设计和制作进行技术交流。以保证烟草WT基因芯片探针设计准确高效、研制策略科学严谨、合同定制严格规范,保障项目预期目标尽早实现。

  会议首先由项目负责人做了“烟草WT基因芯片涵盖基因数据及研制策略”专题汇报。与会专家针对烟草WT基因芯片拟覆盖的基因数据范围进行质询和讨论,鉴于烟草WT基因芯片主要用于栽培烟草基因表达特征和功能挖掘研究,专家建议需要针对基于红花大金元全基因组组装注释的基因重点覆盖设计,在设计探针分布、芯片探针容量、研制技术策略及可预见的数据分析复杂程度等方面进行了充分讨论。随后在听取Affymetrix公司基因芯片设计人员技术报告的基础上,与会专家着重就探针设计类型、分析软件运用及探针集数据归一化算法等问题,同Affymetrix公司基因芯片设计团队进行了深入的探讨和交流。会议期间,郑州烟草研究院与Affymetrix公司签订了“烟草WT基因芯片设计使用烟草基因数据保密协议”。

  通过此次技术论证会议的召开,及时确定了烟草WT基因芯片涵盖基因数据范围和关键研制技术策略,为高质量烟草WT基因芯片的全新研制、项目研究目标的顺利实现奠定坚实基础。

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