近日，中国农业科学院烟草研究所烟草病虫害防控创新团队基于CRISPR/Cas13技术建立了番茄斑萎病毒检测体系。研究通过RPA等温扩增反应与CRISPR/Cas13系统对RNA探针的附带剪切功能，建立一种新的病毒检测体系，可有效检测茄科作物与传毒介体蓟马中的番茄斑萎病毒。相关研究成果发表在《微生物学前沿（Frontiers in Microbiology）》上。

据杨金广研究员介绍，番茄斑萎病毒（Tomato spotted wilt virus，TSWV）属布尼亚病毒科（Bunyaviridae）番茄斑萎病毒属（Tospoviruses）成员。由于其寄主范围广泛，危害严重，是世界10大最严重危害性植物病毒之一，在我国经济作物上发生严重，生产上迫切需要开发一种更加灵敏、快速的检测方法。

CRISPR/Cas系统通常作为基因编辑工具，该团队体外合成的活性Cas13a蛋白可与TSWV靶标N基因crRNA特异性结合，构建CRISPR/Cas13系统，通过该系统附带剪切功能，剪切RPA反应检测体系中的RNA探针，基于荧光强度变化，实现病毒定量检测目的。该技术体系对番茄和西花蓟马中TSWV检测具有高度灵敏度和特异性，最低检测TSWV拷贝数可达2.26×102 copies/μL，优于实时荧光定量pcr技术，可实现单头介体内TSWV定量鉴定检测，对于TSWV病毒病精准预防具有重要实践价值。

烟草所硕士研究生张万红和焦裕冰博士为论文第一作者，杨金广研究员为论文通讯作者。该研究得到中国农业科学院科技创新工程、烟草绿色防控重大科技项目、云南省烟草公司科技计划、四川省烟草公司科技计划和河南省烟草公司洛阳市公司科技计划等项目资助。